כפר נוער הוא מוסד חינוכי-פנימייתי, הפועל ע"פ תפיסה של "קהילה מחנכת" שבה כל עובדי כפר הנוער פועלים כצוות חינוכי עבור חניכי הכפר.
כפרי הנוער קולטים ילדים ובני נוער מרקע שונים ומגוונים, ביניהם כאלו המעוניינים להתפתח אישית בסביבה תומכת, כאלו המגיעים מרקע של מצוקה משפחתית ו/או לימודית, עולים (לרבות פרויקט נעל"ה), ועוד. התכונות המיוחדות של כפר הנוער כמוסד פנימייתי מאפשרות לו, יותר מבתי ספר רגילים בעיר, ליצור הזדמנויות לקידומם של תלמידים הזקוקים לסיוע בלימודים ולטיפוח תרבותי.
מרבית כפרי הנוער בנויים על פי המרכיבים הבאים:
בית ספר – מכין לבגרות עיונית/טכנולוגית ומפעיל תוכניות שונות כגון תוכניות טיפוח לקידום תלמידים שהישגיהם נמוכים, תוכניות לימודים מיוחדות לעולים וכו'. בכל כפר נוער ניתן למצוא קשת רחבה של מגמות לימוד לבחירת התלמידים.
פנימייה –הפנימייה מורכבת מקבוצות חינוכיות, כאשר כל קבוצה מתגוררת בבית מגורים משלה. הקבוצה מקיימת פעולות בתחומים חברתיים-ערכיים, וכמו כן מתקיימות פעילויות פנאי כגון מסיבות, ערבי תרבות, קבלת שבת, פעילויות ספורט, שחיה בבריכה חוגים לטיפוח כישרונות מיוחדים במגוון תחומים (תיאטרון, מוסיקה ריקוד) ועוד. במסגרת הקבוצה התלמידים מכינים את שיעורי הבית ועומד לרשותם מרכז למידה. 
משק חי ומשק חקלאי - במרבית כפרי הנוער קיים משק חי ומשק חקלאי בהם עובדים החניכים בהדרכת מרכז ענף המשק.

הש"שינים בכפרי הנוער מהווים חלק בלתי נפרד מהצוות החינוכי. לרוב, משולב כל ש"שין בצוות העבודה של אחד מענפי הכפר (בכפרים בעלי משק חקלאי) או בעשייה החינוכית במהלך היום, ובשעות אחה"צ והערב משמש כמדריך של קבוצת נערים ביחד עם צוות ההדרכה הבוגר. בנוסף, מפעילה הקומונה – כקבוצה - פרויקטים לכפר כולו.